市場上用量最大的三醛膠因為含有甲醛等物質而使其具有較強的防腐能力，因此防腐問題不突出。
然而綠色環保型的膠黏劑以天然高分子聚合物如淀粉和蛋白為主要生產原料。其營養豐富，很容易受到多種微生物的侵襲，從而導致膠黏劑腐敗變質。其中尤以蛋白基木材膠黏劑及淀粉基木材膠黏劑防腐能力最差，除了部分采用改性的方法得到改善外。多半還是必須借助于添加有效的防腐劑。
天然高分子基的木材膠黏劑防腐與木材防腐的區別在于，木材中養分相對貧乏，主要防腐對象為真菌，防腐方法多以阻斷營養供應的方法來實現。天然高分子基木材膠黏劑與食品類一樣營養豐富，采用阻斷營養供應的方法抑制雜菌不可行，更多的應采用干擾和破壞微生物細胞相關的生理、生化反應和代謝活動的機制：①作用于細胞壁和細胞膜系統；②作用于遺傳物質和遺傳微粒結構；③作用于酶或功能蛋白。
防腐劑實質上是使微生物細胞相關的生理、生化反應和代謝活動受到干擾和破壞，最終導致微生物死亡或繁殖被抑制。破壞菌體的結構和影響代謝作用及生理活動，使細菌無法生存與繁衍。寧正祥等在研究抗菌作用時。發現防腐劑主要是抑制微生物的呼吸作用。導致能量物質ATP和還原力NADH虧缺，所有的合成代謝受阻。活性的動態膜結構不能維持，代謝方向趨于水解，最后產生細胞自溶。該作者還提出了防腐劑的化學結構與電子運動狀態與抗菌性能的關系。具有較高的參考價值。
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